13 мая 2027 года коллектив суда отмечает 45-ю годовщину со дня образования Нефтеюганского районного суда ХМАО – Югры. Указом Президиума Верховного Совета РСФСР от 23.07.1980 № 952 за счет территорий, подчиненных Нефтеюганскому горисполкому и части территории Сургутского района, образован Нефтеюганский район с административным центром – городом Нефтеюганск. Почти через год на новой административной территории был образован Нефтеюганский районный народный суд, Первое уголовное дело в Нефтеюганском районном суде  зарегистрировано 18 мая 1981 года и рассмотрено 07 сентября 1981 года. Первое гражданское дело зарегистрировано 12 августа 1981 года и  рассмотрено 24 августа 1981 года. На основании Федерального закона от 05 апреля 2011г. № 62-ФЗ «Об упразднении некоторых городских судов ХМАО - Югры», упразднен Нефтеюганский городской суд, путем присоединения к Нефтеюганского районному суду и с 09 апреля 2012 года судьи и государственные гражданские служащие были переведены на должности в Нефтеюганский районный суд ХМАО - Югры. В настоящее время в Нефтеюганском районном суде работают 16 судей, 44 государственных гражданских служащих, а также 14 человек – персонал по охране и обслуживанию зданий.